Biologie évolutive sous la direction de FreÂdeŕic Thomas, Thierry LefeÁvre, Michel Raymond

Résumé

La 2e édition de cet ouvrage aborde les grands thèmes de la biologie évolutive, comme la génétique des populations et des métapopulations, l'écologie comportementale, les analyses phylogénétiques, l'évolution moléculaire, les interactions entre espèces.

Directeur de la pub :
Thomas, Frédéric (1970-....)
Directeur de la pub :
Lefevre, Thierry (1982-....) ; Raymond, Michel (1959-....)
Éditeur :
Louvain-la-Neuve, De Boeck supeŕieur,
Genre :
Manuel
Langue :
français.
Note :
Notes bibliogr. Glossaire. Index
Mots-clés :
Nom commun :
Évolution (biologie) | Génétique des populations
Description du livre original :
1 vol. (XXIV-965 p.) : ill. en coul. ; 28 cm
ISBN :
9782807302969.
Domaine public :
Non
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Table des matières

  • Chapitre 9. L’évolution du sexe : un carrefour pour la biologie évolutive.
    • 1. La biodiversité du sexe.
      • 1.1. Qu’est-ce que le sexe ?
        • 1.1.1. Définition.
        • 1.1.2. Sexe et reproduction.
        • 1.1.3. Sexe symétrique et asymétrique.
      • 1.2. Un continuum de modes de reproduction.
        • 1.2.1. La reproduction sexuée exclusive.
        • 1.2.2. Comment se reproduire en se passant de sexe ?
          • 1.2.2.1. Reproduction végétative.
          • 1.2.2.2. Parthénogénèse et agamospermie.
          • 1.2.2.3. Pseudogamie et hybridogénèse.
          • 1.2.2.4. Autofécondation.
          • 1.2.2.5. Un vocabulaire riche mais ambigu.
        • 1.2.3. Alterner sexualité et asexualité.
        • 1.2.4. Reproduction asexuée exclusive.
      • 1.3. Phylogéographie des modes de reproduction.
        • 1.3.1 L’asexualité exclusive est rare et récente.
        • 1.3.2. Détecter et dater l’asexualité.
        • 1.3.3. L’asexualité est plus fréquente dans certains groupes.
        • 1.3.4. Origine de l’asexualité.
        • 1.3.5. Parthénogénèse géographique.
    • 2. Pourquoi le sexe ?
      • 2.1. Les coûts du sexe.
        • 2.1.1. Le coût des mâles.
          • 2.1.1.1. Le coût des mâles et l’anisogamie.
          • 2.1.1.2. Le coût de la fonction mâle chez les hermaphrodites.
          • 2.1.1.3. Le coût de la méiose.
        • 2.1.2. Les coûts liés à l’allofécondation.
          • 2.1.2.1. Le faible coût des gamètes mâles en autofécondation.
          • 2.1.2.2. Non assurance de reproduction.
        • 2.1.3. Les coûts liés aux conflits génétiques.
        • 2.1.4. Les coûts mécaniques.
        • 2.1.5. Les coûts génétiques.
      • 2.2. Contraintes sur l’évolution du sexe.
        • 2.2.1. Combiner des mutations individuellement délétères.
        • 2.2.2. Le sexe est-il maintenu par sélection entre espèces ?
      • 2.3. Sélection directe : le sexe pour réparer l’Adn ?
      • 2.4. Sélection indirecte : le sexe pour réduire les associations génétiques ?
        • 2.4.1. Le sexe élimine les associations génétiques.
        • 2.4.2. Comprendre les pressions de sélection sur la recombinaison.
          • 2.4.2.1. Modificateur de recombinaison.
          • 2.4.2.2. Effet sur la valeur sélective moyenne.
          • 2.4.2.3. Effet sur la variance de valeur sélective.
          • 2.4.2.4. Effet total.
        • 2.4.3. Les sources d’associations génétiques.
          • 2.4.3.1. Épistasie.
          • 2.4.3.2. Épistasie fluctuante.
          • 2.4.3.3. Migration.
          • 2.4.3.4. Effet Hill-Robertson.
          • 2.4.3.5. « Tangled bank » et compétition entre apparentés.
        • 2.4.4. Quelques idées reçues.
          • 2.4.4.1. Le sexe génère- t-il de la variation ?
          • 2.4.4.2. La variation est-elle favorable ?
    • 3. Les conséquences du sexe.
      • 3.1. Le sexe et la logique des conflits génétiques.
        • 3.1.1. Conflits au sein du génome nucléaire.
          • 3.1.1.1. Cycle de vie haplodiplontique.
          • 3.1.1.2. La ségrégation mendélienne et les conflits entre allèles.
          • 3.1.1.3. Un génome nucléaire peuplé d’éléments « égoïstes ".
          • 3.1.1.4. L’effet des éléments « égoïstes ".
        • 3.1.2. Conflits entre génomes cytoplasmiques.
          • 3.1.2.1. Hérédité uniparentale des organelles.
          • 3.1.2.2. Seulement deux sexes ?
        • 3.1.3. Conflit mâle-femelle.
          • 3.1.3.1. L’anisogamie.
          • 3.1.3.2. Conflit d’allocation en ressources entre descendants.
        • 3.1.4. Conflit nucléo-cytoplasmique.
      • 3.2. Les adaptations liées au sexe.
        • 3.2.1. Ploïdie.
        • 3.2.2. Diversité et évolution des types sexuels.
          • 3.2.2.1. Sexes et classes de compatibilité.
          • 3.2.2.2. Types sexuels.
          • 3.2.2.3. Allocation des ressources aux fonctions sexuelles.
          • 3.2.2.4 Déterminisme du sexe : génétique versus environnemental.
          • 3.2.2.5. Diversité des déterminismes génétiques des sexes.
          • 3.2.2.6. Évolution des chromosomes sexuels.
        • 3.2.3. Sex-ratio.
          • 3.2.3.1. Sex-ratio chez les espèces dioïques[ ] / [ ]gonochoriques.
            • Sex-ratio en population structurée
            • Sex-ratio primaire et secondaire.
            • Sex-ratio dans des groupes sociaux hiérarchiques.
          • 3.2.3.2. Sex-ratio chez les espèces polymorphes non dioïques.
        • 3.2.4. Systèmes de croisement.
          • 3.2.4.1. Reconnaissance interspécifique.
          • 3.2.4.2. L’exogamie est-elle délétère ?
          • 3.2.4.3. La consanguinité est-elle délétère ?
          • 3.2.4.4. Comment éviter la consanguinité chez les hermaphrodites ?
          • 3.2.4.5. Éviter ou pratiquer l’autofécondation ?
          • 3.2.4.6. Décompte de pollen, décompte d’ovules et dépression variable.
          • 3.2.4.7 Distribution de l’autofécondation et évolution dans les différents phylums.
          • 3.2.4.8. Éviter la consanguinité chez les espèces gonochoriques.
    • 4. Conclusion.
  • Chapitre 10. Évolution des traits d’histoire de vie.
    • 1 Introduction.
    • 2. Démographie et évolution des populations structurées en âge.
      • 2.1 Introduction.
      • 2.2. Patrons de variation des traits d’histoire de vie en fonction de l’âge.
      • 2.3. Analyses démographiques des populations structurées en âge.
      • 2.4. de la démographie vers l’évolution des populations structurées en âge.
        • 2.4.1. Génétique des populations.
        • 2.4.2. Génétique quantitative.
        • 2.4.3. Optimisation, stratégie évolutivement stable et analyses d’invasion.
        • 2.4.4. Évolution et densité-dépendance dans les populations structurées en âge.
      • 2.5. Le concept de stratégies biodémographiques.
        • 2.5.1 Notion de covariation.
        • 2.5.2. Les axes de variation des stratégies (bio)démographiques.
        • 2.5.3. L’allométrie et les contraintes de plan.
        • 2.5.4. Notion de bet-hedging.
    • 3. Contraintes, compromis et corrélations entre traits d’histoire de Vie.
      • 3.1. Les mécanismes qui sous-tendent l’antagonisme entre fonctions.
      • 3.2. Antagonisme fonctionnel et corrélations entre traits d’histoire de vie.
      • 3.3. Comment mesurer les compromis entre traits d’histoire de vie ?
      • 3.4.Conclusions et questions ouvertes.
    • 4. Âge et taille à la maturité.
      • 4.1 Introduction.
      • 4.2. Une transition cruciale soumise à de fortes pressions de sélection.
        • 4.2.1. Bases du compromis entre âge et taille à maturité.
          • 4.2.1.1. Croître ou se reproduire ?
          • 4.2.1.2. Bénéfices d’une maturation précoce.
          • 4.2.1.3. Coûts liés à une maturation précoce.
            • Fécondité.
            • Qualité des jeunes.
            • Taille adulte.
            • Survie.
          • 4.2.1.4. Un compromis entre reproduction actuelle et future.
        • 4.2.2. L’âge et la taille à maturité peuvent-ils évoluer ?
          • 4.2.2.1. Variabilité génétique dans les populations naturelles.
          • 4.2.2.2. Corrélations génétiques entre les paramètres de la maturation.
        • 4.2.3. Stratégies de maturation sur une trajectoire de croissance donnée : prédictions et tests.
        • 4.2.4. Ajustement de l’investissement dans la première reproduction.
      • 4.3. Ajustement des stratégies de maturation aux conditions de croissance.
        • 4.3.1. La taille comme déterminant de la maturation.
        • 4.3.2. L’âge comme déterminant de la maturation.
        • 4.3.3. Des stratégies de maturation plastiques.
        • 4.3.4. Évolution des taux de croissance et de la maturation.
      • 4.4. Les stratégies de maturation sont façonnées par la mortalité.
        • 4.4.1. effets de la mortalité extrinsèque : prédictions.
        • 4.4.2. Effet de la prédation taille-dépendante.
          • 4.4.2.1. Surexploitation des pêcheries et modification de la maturation des populations de poissons.
          • 4.4.2.2. Prédation taille-dépendante et maturation des daphnies.
        • 4.4.3. Survie larvaire et durée de développement.
        • 4.4.4. Coûts liés à des mécanismes de défense.
      • 4.5. Changements environnementaux et maturation.
        • 4.5.1. Ajustement saisonnier de la date de floraison des espèces annuelles.
        • 4.5.2. Ajustement de la durée de développement larvaire chez une salamandre.
        • 4.5.3. Ajustement conjoint du taux de croissance et de la métamorphose chez un papillon.
        • 4.5.4. Ajustement des stratégies de maturation en environnement hétérogène.
      • 4.6. Conclusion
    • 5 Nombre et taille des descendants.
      • 5.1. Introduction.
      • 5.2. Nombre de descendants.
        • 5.2.1. Taille de ponte optimale.
        • 5.2.2. Le coût de la reproduction.
          • 5.2.2.1. Compromis physiologiques.
          • 5.2.2.2. Coûts non physiologiques.
          • 5.2.2.3. Corrélations génétiques.
        • 5.2.3. Bet-hedging.
        • 5.2.4. Mortalité âge-dépendant et évolution de l’effort de reproduction.
          • 5.2.4.1. Investissement terminal.
      • 5.3. Taille des descendants.
        • 5.3.1. Compromis entre le nombre et la taille des descendants.
    • 6. Évolution de la sénescence et de la longévité.
      • 6.1. Évolution, sénescence et longévité.
      • 6.2. Patrons de variation de la longévité.
      • 6.3. La sénescence est-elle universelle ?
        • 6.3.1. Mesurer la sénescence.
        • 6.3.2. Les défis méthodologiques.
        • 6.3.3. Organismes multicellulaires avec séparation soma-germen.
        • 6.3.4. organismes multicellulaires sans séparation soma-germen.
        • 6.3.5. Organismes unicellulaires.
      • 6.4. Théories d’évolution de la sénescence.
        • 6.4.1. Les premiers modèles et la cause ultime d’évolution de la sénescence.
        • 6.4.2. L’accumulation de mutations délétères à action tardive.
        • 6.4.3. Les modèles d’optimisation et la pléiotropie antagoniste.
      • 6.5. Tester les modèles théoriques.
        • 6.5.1. Le compromis entre longévité et fécondité.
        • 6.5.2. Prédictions en génétique quantitative.
        • 6.5.3. Mortalité extrinsèque et sénescence.
      • 6.6. Perspectives : une approche intégrative.
  • Chapitre 11. La sélection sexuelle.
    • 1. Les données du problème.
      • 1.1. Définition du processus de sélection sexuelle.
      • 1.2. Sélection intrasexuelle vs. sélection intersexuelle.
      • 1.3. Sur quel sexe opère la sélection sexuelle ?
        • 1.3.1. Importance de la variance dans le succès reproducteur.
          • 1.3.1.1. L’anisogamie et ses conséquences.
          • 1.3.1.2. Les travaux de Bateman.
          • 1.3.1.3. Validité du « principe » de Bateman.
        • 1.3.2. Sex-ratio opérationnel.
        • 1.3.3. Succès reproducteur à long terme et coûts différentiels entre les sexes.
        • 1.3.4. Conclusion.
      • 1.4. Quantification de la sélection sexuelle.
        • 1.4.1. Variance relative du succès d’appariement.
        • 1.4.2. Différentiel de sélection et gradients de sélection.
    • 2. Évolution des caractères phénotypiques par sélection sexuelle.
      • 2.1. Introduction.
      • 2.2. Sélection intrasexuelle.
        • 2.2.1. Compétition pour l’accès au partenaire sexuel.
          • 2.2.1.1. Compétition par interférence.
            • 2.2.1.1.1. Caractères statiques.
            • 2.2.1.1.2. Caractères dynamiques.
          • 2.2.1.2. Compétition par exploitation.
            • 2.2.1.2.1. Limites à l’amplification des caractères par sélection intrasexuelle.
        • 2.2.2. Compétition spermatique.
          • 2.2.2.1 Compétition spermatique par exploitation.
            • 2.2.2.1.1. Effet sur les mâles.
            • 2.2.2.1.2. Effet sur les spermatozoïdes.
          • 2.2.2.2. Compétition spermatique par interférence.
            • 2.2.2.2.1. Effet sur les mâles.
            • 2.2.2.2.2. Effet sur les spermatozoïdes.
          • 2.2.2.3. Existe-t-il un compromis entre compétition post-copulatoire et compétition pré-copulatoire ?
      • 2.3. Sélection intersexuelle.
        • 2.3.1. Sélection directe sur la préférence des femelles.
          • 2.3.1.1. Obtention de bénéfices directs.
          • 2.3.1.2. Exploitation sensorielle.
          • 2.3.1.3. Conflit sexuel.
        • 2.3.2. Sélection indirecte sur la préférence des femelles.
          • 2.3.2.1. Préférence arbitraire et processus d’emballement.
            • 2.3.2.1.1. Dynamique du processus d’emballement.
            • 2.3.2.1.2. Limites au processus d’emballement.
            • 2.3.2.1.3. Évidence en faveur du processus d’emballement.
          • 2.3.2.2. L’hypothèse des bons gènes.
            • 2.3.2.2.1. Bénéfices indirects et principe du handicap.
            • 2.3.2.2.2. Évidence en faveur du principe du handicap.
            • 2.3.2.2.3. Le paradoxe du lek.
            • 2.3.2.2.4. L’hypothèse du handicap d’immunocompétence.
            • 2.3.2.2.5. Bons gènes versus hétérozygotie.
            • 2.3.2.2.6. L’hypothèse des bons gènes est-elle réellement pertinente ?
          • 2.3.2.3. L’hypothèse de compatibilité.
        • 2.3.3. Choix cryptique des femelles.
      • 2.4. Conclusion : vers une théorie synthétique de la sélection sexuelle ?
  • Chapitre 12. Évolution et typologie des régimes d'appariement.
    • 1 Introduction.
      • 1.1. Pour la petite histoire…
      • 1.2. Un conflit d’intérêt.
      • 1.4. Distinguer les composantes pour distinguer les pressions de sélection.
    • 2 Les organisations sociales.
      • 2.1. Typologie des organisations sociales.
        • 2.1.1. Les espèces solitaires.
        • 2.1.2. Les couples et les familles.
          • 2.1.2.1. Les couples territoriaux.
          • 2.1.2.2. Les couples non territoriaux.
          • 2.1.2.3. Les familles élargies.
        • 2.1.3. Les groupes unisexués.
        • 2.1.4. Les groupes bisexués.
          • 2.1.4.1. Les groupes « unimâles ".
          • 2.1.4.2. Les groupes « unifemelles ".
          • 2.1.4.3. Les groupes « multimâles[ ] / [ ]multifemelles ".
      • 2.2. Évolution des organisations sociales.
        • 2.2.1. Les causes évolutives du groupement.
        • 2.2.2. Les causes de la ségrégation sexuelle.
        • 2.2.3. Les causes de la stabilité des associations.
    • 3. Le partage des soins parentaux.
      • 3.1. Typologie du partage des soins parentaux.
        • 3.1.1. L’absence de soins parentaux.
        • 3.1.2. Les soins monoparentaux maternels.
        • 3.1.3. Les soins monoparentaux paternels.
        • 3.1.4. Les soins biparentaux.
      • 3.2. Évolution des soins parentaux.
        • 3.2.1. L’apparition des soins parentaux.
        • 3.2.2. Évolution des soins monoparentaux.
        • 3.2.3. Évolution des soins biparentaux.
    • 4. Les tactiques d’accès aux partenaires sexuels .
      • 4.1. Typologie des tactiques d’accès aux partenaires.
        • 4.1.1. Le contrôle des ressources.
        • 4.1.2. Le contrôle des femelles.
        • 4.1.3 Les leks.
        • 4.1.4. La course aux partenaires.
          • 4.1.4.1. Les femelles sont très dispersées.
          • 4.1.4.2. Les femelles sont très groupées.
      • 4.2. Évolution des tactiques d’accès aux partenaires.
        • 4.2.1. Notion de ressources économiquement défendables.
        • 4.2.2. Pourquoi les mâles se regroupent-ils pour former des leks ?
          • 4.2.2.1. Agrégation des territoires dictée par le choix des femelles.
          • 4.2.2.2. Agrégation indépendante du choix des femelles.
    • 5. Le nombre de partenaires sociaux.
      • 5.1. Typologie des régimes d’appariement sociaux.
        • 5.1.1. La monogamie sociale.
        • 5.1.2. La polygynie sociale.
        • 5.1.3. La polyandrie sociale.
        • 5.1.4. La promiscuité sociale.
      • 5.2. Évolution des régimes d’appariement sociaux.
        • 5.2.1. Les causes évolutives de la formation de couples.
        • 5.2.2. Les causes évolutives des appariements bisexués.
          • 5.2.2.1. Cas des appariements bisexués unimâles.
          • 5.2.2.2. Cas des appariements bisexués unifemelles.
        • 5.2.3. Les causes du changement de partenaire social.
    • 6. Le nombre de partenaires sexuels.
      • 6.1 Typologie des régimes d’appariement génétique.
        • 6.1.1. L’exclusivité entre partenaires.
        • 6.1.2. L’accouplement d’un mâle avec plusieurs femelles.
        • 6.1.3. L’accouplement d’une femelle avec plusieurs mâles.
        • 6.1.4. La promiscuité sexuelle.
      • 6.2. Évolution des régimes d’appariement génétique.
        • 6.2.1. Pourquoi les femelles s’accouplent-elles avec plusieurs mâles ?
          • 6.2.1.1. Rôle passif des femelles.
          • 6.2.1.2. Rôle actif des femelles.
        • 6.2.2. Évolution des copulations hors couples.
          • 6.2.2.1. Les bénéfices directs.
          • 6.2.2.2. Les bénéfices génétiques.
        • 6.2.3. Pourquoi les mâles ne s’accouplent-ils qu’avec une seule femelle ?
    • 7. Relations entre composantes.
    • 8. Dynamique des régimes d’appariement.
    • 9. Quel avenir pour l’étude des régimes d’appariement ?
  • Fin de la lecture de :

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